Το INSPIRE στοχεύει να προσδιορίσει περιοχές προτεραιότητας για διατήρηση στα ελληνικά χωρικά ύδατα και συμβάλλοντας λεκάνες απορροής στο Αιγαίο Πέλαγος για την επίτευξη των στόχων της Στρατηγικής για τη Βιοποικιλότητα για το 2030, λαμβάνοντας υπόψη: τους προστατευόμενους και απειλούμενους φυσικούς τύπους οικοτόπων και είδη, τη κλιματική αλλαγή και τις βιολογικές εισβολές, τη διάδοση των απειλών που προέρχονται από τη χέρσο μέσω των ποταμών από τις γειτονικές χώρες, συνέργειες και αντισταθμίσεις με τις κύριες θαλάσσιες βιομηχανίες (αλιεία, τουρισμός).

Το INSPIRE στοχεύει στον εντοπισμό περιοχών για την επέκταση του δικτύου Natura 2000 ώστε να αυξηθεί η χωρική συνοχή του δικτύου στο σύστημα λεκάνη απορροής - εκβολές ποταμών - θάλασσα, αντιμετωπίζοντας τα κενά που υπάρχουν στον χωρικό σχεδιασμό στη συνδεσιμότητα, τη διάδοση και τη συσσώρευση πιέσεων σε διαφορετικά περιβάλλοντα. Το έργο θα ασχοληθεί επίσης με τη διατήρηση της βιοποικιλότητας πέραν των προστατευόμενων περιοχών, λαμβάνοντας υπόψη πρόσθετους στόχους και παραγωγικούς τομείς, όπως η γεωργία και η επαγγελματική αλιεία, εντοπίζοντας και ελαχιστοποιώντας πιθανές αντισταθμίσεις.

Το INPSIRE αποσκοπεί στον εντοπισμό περιοχών όπου η διαχείριση της βιοποικιλότητας μπορεί να γίνει πιο αποτελεσματική και όπου συγκεκριμένες δράσεις θα μπορούσαν να οδηγήσουν σε καλύτερα αποτελέσματα για τη βιοποικιλότητα και τις οικοσυστημικές υπηρεσίες. Η περιοχή μελέτης θα καλύψει τα ποτάμια και χερσαία συστήματα, ενσωματώνοντας πολλαπλές τομεακές απαιτήσεις για τον εντοπισμό πιθανών συνεργειών και αντισταθμίσεων, καθώς και τη συμπερίληψη κλιματικών σεναρίων που σχετίζονται με τη μείωση των κατακρημνισμάτων με αποτέλεσμα την απώλεια επιφανειακών υδάτων.